Slovenská botanická spoločnosť je reprezentantkou slovenskej botanickej obce, obhajuje záujmy slovenskej botaniky a bdie nad stavom rastlinstva Slovenska ako nenahraditeľného zdroja a bohatstva národa.
Slovenská botanická spoločnosť sa podieľa na rozvoji, propagácii botaniky v Slovenskej republike, prognostickej činnosti a na ochrane druhového bohatstva kveteny Slovenska.
Spoločnosť podporuje rozvoj slovenskej botaniky podnecovaním a usmerňovaním vedeckej a vedecko-organizačnej práce, vytyčuje jej úlohy, navrhuje a realizuje projekty botanického výskumu;
Orientuje záujem členov na riešenie najnaliehavejších a najvýznamnejších otázok z hľadiska potrieb ochrany flóry a vegetácie Slovenska na racionálne využívanie prírodných a kultúrnych porastov;
Rozvíja prognostickú činnosť, organizuje, prehlbuje a
koordinuje spoluprácu svojich členov;
Prispieva k zvyšovaniu odbornej úrovne svojich členov a všestranne im v ich odbornej činnosti poskytuje pomoc;
Predkladá príslušným odborným a štátnym orgánom SR podnety a návrhy týkajúce sa problematiky botaniky a vegetácie Slovenska;
Sleduje stav úrovne vyučovania botaniky na školách všetkých stupňov, zvýšenú pozornosť venuje záujemcom z radov mládeže.